Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc43Q3V0L5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms