Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SHC1P29353 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SHC1P29353 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms