Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ApcsP12246 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ApcsP12246 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms