Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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BC117090L7N257 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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BC117090L7N257 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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BC117090L7N257 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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BC117090L7N257 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BC117090L7N257 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BC117090L7N257 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BC117090L7N257 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BC117090L7N257 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BC117090L7N257 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BC117090L7N257 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BC117090L7N257 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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BC117090L7N257 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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