Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm8298J3QPI0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm8298J3QPI0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms