Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Cldn6Q9Z262 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn6Q9Z262 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cldn6Q9Z262 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cldn6Q9Z262 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cldn6Q9Z262 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cldn6Q9Z262 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Cldn6Q9Z262 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn6Q9Z262 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Cldn6Q9Z262 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn6Q9Z262 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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