Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chmp3Q9CQ10 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chmp3Q9CQ10 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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