Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM72Q6ZMU5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM72Q6ZMU5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms