Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ssx9Q6XAS3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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