Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Top2bQ64511 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Top2bQ64511 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Top2bQ64511 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Top2bQ64511 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Top2bQ64511 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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