Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zfp248Q640N4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zfp248Q640N4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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