Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

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Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Defa17Q64016 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Defa17Q64016 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Defa17Q64016 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Defa17Q64016 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Defa17Q64016 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Defa17Q64016 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Defa17Q64016 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Defa17Q64016 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Defa17Q64016 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Defa17Q64016 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Defa17Q64016 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms