Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rai1Q61818 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rai1Q61818 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms