Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Ap5b1Q3TAP4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ap5b1Q3TAP4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap5b1Q3TAP4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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