Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Pate4Q09098 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Pate4Q09098 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms