Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxc10P31257 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms