Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P0C1Z5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms