Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P06323 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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P06323 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P06323 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P06323 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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