Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Vmn1r34G3XA52 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Vmn1r34G3XA52 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Vmn1r34G3XA52 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Vmn1r34G3XA52 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Vmn1r34G3XA52 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Vmn1r34G3XA52 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Vmn1r34G3XA52 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Vmn1r34G3XA52 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vmn1r34G3XA52 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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