Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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