Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm3550W4VSN7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms