Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nectin3Q9JLB9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nectin3Q9JLB9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.8 ms