Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prg3Q9JL95 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms