Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SelenofQ9ERR7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms