Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms