Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atf3Q60765 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms