Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fam208bQ5DTT3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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