Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rnf180Q3U827 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf180Q3U827 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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