Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3c3Q3TMP1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms