Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gja5Q01231 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms