Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rrp1P56183 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms