Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Sdc1P18828 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sdc1P18828 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sdc1P18828 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sdc1P18828 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sdc1P18828 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sdc1P18828 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sdc1P18828 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms