Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms