Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
Sfta2E9PXB6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms