Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Rtf1A2AQ19 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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Rtf1A2AQ19 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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Rtf1A2AQ19 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rtf1A2AQ19 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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Rtf1A2AQ19 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rtf1A2AQ19 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms