Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Tspan13Q9D8C2 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms