Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms