Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRG4Q92954 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms