Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf144aQ925F3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf144aQ925F3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rnf144aQ925F3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rnf144aQ925F3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rnf144aQ925F3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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