Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Snx15Q91WE1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms