Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc6a20aQ8VDB9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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