Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SnrpcQ62241 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SnrpcQ62241 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms