Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Cln3Q61124 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cln3Q61124 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cln3Q61124 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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