Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4AQ13619 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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