Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Scg2Q03517 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scg2Q03517 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms