Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samsn1P57725 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms