Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms