Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChkaO54804 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChkaO54804 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChkaO54804 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChkaO54804 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChkaO54804 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChkaO54804 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ChkaO54804 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ChkaO54804 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms