Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Defa35E9QLQ1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Defa35E9QLQ1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Defa35E9QLQ1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Defa35E9QLQ1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Defa35E9QLQ1 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Defa35E9QLQ1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Defa35E9QLQ1 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Defa35E9QLQ1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Defa35E9QLQ1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Defa35E9QLQ1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Defa35E9QLQ1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Defa35E9QLQ1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Defa35E9QLQ1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Defa35E9QLQ1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa35E9QLQ1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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