Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SETD1BQ9UPS6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1BQ9UPS6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms